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Text File  |  1995-03-04  |  1.8 KB  |  35 lines
  1. *******************************************************
  2. * DDC / GAD / HDC pyridoxal-phosphate attachment site *
  3. *******************************************************
  4.  
  5. Three different  enzymes  -  all pyridoxal-dependent decarboxylases -  seem to
  6. share regions  of sequence similarity [1,2], especially in the vicinity of the
  7. lysine residue which serves as the attachment site for the pyridoxal-phosphate
  8. (PLP) group. These enzymes are:
  9.  
  10.  - Glutamate decarboxylase (EC 4.1.1.15) (GAD).  Catalyzes the decarboxylation
  11.    of glutamate into the neurotransmitter GABA (4-aminobutanoate).
  12.  - Histidine decarboxylase (EC 4.1.1.22) (HDC).  Catalyzes the decarboxylation
  13.    of histidine to histamine. There are two completely unrelated types of HDC:
  14.    those that  use  PLP    as  a cofactor (found in gram-negative bacteria and
  15.    mammals), and those that contain a covalently bound pyruvoyl residue (found
  16.    in gram-positive bacteria).
  17.  - Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  (EC 4.1.1.28)  (DDC),  also  known  as
  18.    L-dopa  decarboxylase  or   tryptophan  decarboxylase.   DDC  catalyzes the
  19.    decarboxylation of  tryptophan to tryptamine.  It  also  acts on 5-hydroxy-
  20.    tryptophan and dihydroxyphenylalanine (L-dopa).
  21.  
  22. -Consensus pattern: S-[LIVMFYW]-x(5)-K-[LIVMFYWG](2)-x(3)-[LIVMFYW]-x-C-x(2)-
  23.                     [LIVMFYW]-x(2)-[RK]
  24.                     [K is the pyridoxal-P attachment site]
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  26.  for a probable Caenorhabditis elegans DDC.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  28. -Last update: June 1994 / Text revised.
  29.  
  30. [ 1] Jackson F.R.
  31.      J. Mol. Evol. 31:325-329(1990).
  32. [ 2] Joseph D.R., Sullivan P., Wang Y.-M., Kozak C., Fenstermacher D.A.,
  33.      Behrendsen M.E., Zahnow C.A.
  34.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87:733-737(1990).
  35.